Промишлените работни процеси за подготовка на кафеените зърна трябва да се прилагат непосредствено след прибирането на реколтата, в противен случай месестата част на плода ферментира и продуктът се разваля. Подготовката може да се извършва по сух и по мокър метод.
При подготовката по сухия метод се получава „естествено“ кафе, както се нарича на жаргон. Набраните кафеени плодове се сушат на слънце в продължение на ок. 4 седмици върху приблизително 50 м² площ според големината на плантацията. При това трябва да се обръщат от време на време, за да изсъхнат равномерно. Сухите семена се обелват с машина, като преминават през два валяка, разположени на определено разстояние, за да могат зърната да изпаднат. След това отделянето на зърната от люспите се извършва през сито.
По мокрия метод се получава кафе, което на жаргон се нарича „измито“. Плодовете се почистват предварително грубо и се накисват за 36 часа във вода. При този процес узрелите плодове потъват на дъното на съда (потапяне), а неузрелите или презрелите кафеени плодове остават да плуват на повърхността. За да се отстрани месестата част от ядката, зрелите кафеени плодове се пресоват през сито или се надробяват с валяци.
Останалата по ядката слуз се отстранява чрез ферментация. След това остатъците от ферментацията се отмиват обилно с прясна вода.
Поради голямото количество вода мокрият метод с ферментация не може да се използва при кафета, които изискват трайност, въпреки че чрез него се получава сурово кафе с по-добро качество. Освен това има и машини, които могат да заменят ферментацията.
При полирането се отстранява сребърната ципа на кафееното зърно. Тя не само не изглежда красиво върху зърното, но може и да въздейства върху аромата при печенето. Не всички производители на сурово кафе полират кафеените зърна.
След преработката суровото кафе се класифицира. Тъй като това се извършва по различни начини, като например пресяване или външен оглед, то автоматично се проверява и за наличие на чужди тела. По този начин се отстраняват малки клончета, камъчета, останали обвивки и други чужди тела. Фактът, че почти всяка мелачка на напълно автоматична машина има функция за разпознаване на камъни, показва, че въпреки всичко нещо може да убегне при крайната проверка на естествения продукт кафе.
